Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf1bP25119 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf1bP25119 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf1bP25119 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf1bP25119 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf1bP25119 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf1bP25119 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf1bP25119 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms