Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd247P24161 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms