Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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Hoxd11P23813 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd11P23813 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Hoxd11P23813 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd11P23813 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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