Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZfaP23607 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZfaP23607 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZfaP23607 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZfaP23607 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZfaP23607 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms