Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja1P23242 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gja1P23242 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja1P23242 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms