Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PparaP23204 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PparaP23204 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PparaP23204 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PparaP23204 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PparaP23204 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PparaP23204 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PparaP23204 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PparaP23204 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms