Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tap1P21958 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tap1P21958 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms