Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmnb2P21619 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms