Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb9P20615 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms