Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcaP20444 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms