Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VimP20152 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VimP20152 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VimP20152 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VimP20152 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VimP20152 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VimP20152 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VimP20152 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VimP20152 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VimP20152 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VimP20152 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VimP20152 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms