Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpl13aP19253 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms