Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnc1P19123 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms