Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18526 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P18526 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18526 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18526 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18526 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18526 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18526 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18526 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18526 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18526 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18526 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18526 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms