Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18525 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18525 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18525 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18525 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18525 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18525 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18525 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms