Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa-rs1P17533 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms