Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmga1P17095 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms