Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sptan1P16546 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms