Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rag1P15919 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rag1P15919 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms