Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnmt1P13864 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnmt1P13864 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms