Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rb1P13405 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rb1P13405 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms