Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkar1bP12849 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms