Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms