Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga5P11688 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga5P11688 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms