Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd1d1P11609 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms