Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl2P10889 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl2P10889 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms