Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Amd1P0DMN7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms