Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
UbbP0CG49 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbbP0CG49 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms