Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf1P09925 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf1P09925 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms