Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna9P09235 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna9P09235 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms