Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa6P09092 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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