Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb5P09079 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb5P09079 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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