Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd3P09027 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd3P09027 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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