Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NeflP08551 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NeflP08551 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NeflP08551 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeflP08551 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NeflP08551 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeflP08551 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeflP08551 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms