Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Egr1P08046 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms