Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf1P07141 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf1P07141 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms