Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa4P06798 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa4P06798 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms