Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06344 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06344 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06344 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06344 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06344 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06344 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06344 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms