Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JunP05627 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JunP05627 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JunP05627 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JunP05627 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JunP05627 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JunP05627 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JunP05627 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JunP05627 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JunP05627 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JunP05627 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JunP05627 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms