Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tk1P04184 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tk1P04184 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms