Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01800 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01800 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01800 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01800 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01800 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms