Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01797 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01797 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01797 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01797 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01797 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01797 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01797 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01797 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P01797 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01797 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01797 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01797 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01797 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01797 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms