Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01667 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01667 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01667 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01667 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01667 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01667 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01667 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01667 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01667 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389.3 ms