Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01648 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01648 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01648 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01648 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01648 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01648 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01648 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01648 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01648 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01648 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01648 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01648 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms