Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01638 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01638 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01638 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01638 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01638 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01638 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01638 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01638 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01638 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01638 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01638 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01638 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01638 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01638 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01638 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms