Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igk-V19-17P01633 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igk-V19-17P01633 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Igk-V19-17P01633 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igk-V19-17P01633 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igk-V19-17P01633 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igk-V19-17P01633 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms