Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PomcP01193 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PomcP01193 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PomcP01193 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PomcP01193 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PomcP01193 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms