Protein–RNA interactions for Protein: P00375

Dhfr, Dihydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhfrP00375 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DhfrP00375 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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DhfrP00375 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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DhfrP00375 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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DhfrP00375 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DhfrP00375 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms