Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lancl1O89112 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms