Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BlmO88700 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BlmO88700 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BlmO88700 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BlmO88700 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BlmO88700 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BlmO88700 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BlmO88700 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BlmO88700 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BlmO88700 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BlmO88700 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BlmO88700 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BlmO88700 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BlmO88700 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BlmO88700 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BlmO88700 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BlmO88700 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BlmO88700 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BlmO88700 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BlmO88700 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BlmO88700 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BlmO88700 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BlmO88700 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BlmO88700 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BlmO88700 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms